Un giorno, recandosi alla fabbrica, Jeremy e gli altri vi trovano nientemeno che Franz Hopper, il creatore del mondo di Lyoko. Lo scienziato accusa Jeremy di aver voluto giocare con qualcosa che andava al di là della sua comprensione, avendo usato il programma di virtualizzazione prima che fosse completato, con gravi rischi per l'incolumità dei suoi compagni. Ciò causa una spaccatura tra Jeremy e il resto del gruppo, al punto che il ragazzo accetta la proposta del padre di trasferirsi in una scuola per studenti dotati. In realtà, il sedicente Franz Hopper è XANA.